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作为一个类群，古生菌在生理学和形态学上都是多种多样的。它们可以是需氧的、兼性厌氧的或是严格厌氧的。营养上它们从化能无机自养生物到有机营养生物。一些是中温生物；另一些是能在100℃以上生长的超嗜热生物。古生菌形态学上也是多种多样的，一些古生菌可以通过二分裂、芽殖或其他的机制增殖。它们有的是单细胞，然而也可以形成菌丝体或团聚体。
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